磁力泵的軸承、內磁轉子和隔套在運行中都會(huì )產(chǎn)生熱量，這將使工作溫度升高，一方面使傳遞的功率下降，另一方面對輸送易汽化液體的磁力泵會(huì )產(chǎn)生很大的麻煩。
磁鋼傳遞的功率隨溫度的升高是一條連續下降的曲線(xiàn)，通常，在磁鋼工作極限溫度以下，其傳遞能力的下降是可逆的，而在極限溫度以上則是不可逆的，即磁鋼冷卻后，喪失的傳遞能力再也不能恢復。特殊情況下在磁力聯(lián)軸器出現滑脫(失步)時(shí)，隔套中的渦流熱量會(huì )急劇增長(cháng)，溫度急劇上升，如不及時(shí)處理，會(huì )引起磁鋼退磁，使磁力聯(lián)軸器失效。因此磁力泵應設計可靠的冷卻系統。
對不易汽化的介質(zhì)，冷卻循環(huán)系統一般由葉輪出口或泵出口引出液流，經(jīng)軸承和磁傳動(dòng)部分回到吸人口，對易汽化的介質(zhì)，應增加換熱器或將液流引到泵外的貯罐，避免熱量回到吸人口，對有固體雜質(zhì)或鐵磁性雜質(zhì)的介質(zhì)，應考慮過(guò)濾，對高溫介質(zhì)，則應考慮冷卻，以保證磁力聯(lián)軸器不超過(guò)工作極限溫度。
泵運轉時(shí)，必須用少量的液體對內磁轉子與隔離套之間的環(huán)隙區域和滑動(dòng)軸承的摩擦副進(jìn)行沖洗冷卻。冷卻液的流量通常為泵設計流量的2%-3%，內磁轉子與隔離套之間的環(huán)隙區域由于渦流而產(chǎn)生高熱量。
當冷卻潤滑液不夠或沖洗孔不暢、堵塞時(shí)，將導致介質(zhì)溫度高于永磁體的工作溫度，使內磁轉子逐步失去磁性，使磁力傳動(dòng)器失效。當介質(zhì)為水或水基液時(shí)，可使環(huán)隙區域的溫升維持在3-5℃；當介質(zhì)為烴或油時(shí)，可使環(huán)隙區域的溫升維持在5-8℃。
